治療方法により再発率は異なります。アメリカで行われている一般的な治療は 自分で処理する方法ですが、ウイルスや病巣を除去する免疫機能を促進する 5%免疫クリームが使われます。これは13~19%の確率で再発します。
大きなイボには時々、麻酔を使う外科的手術が行われます。これでも再発率は約21%です。自分でポドフィロックス軟膏を使用するのでは、治癒率は わずか51%しかなく、再発率は約10%でした。液体窒素療法では再発率は高く、73%に及びます。